Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx4P70452 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx4P70452 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx4P70452 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms