Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ufd1P70362 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufd1P70362 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms