Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smad1P70340 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smad1P70340 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smad1P70340 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms