Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stra8P70278 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stra8P70278 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stra8P70278 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms