Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NficP70255 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NficP70255 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NficP70255 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NficP70255 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NficP70255 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NficP70255 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NficP70255 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NficP70255 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NficP70255 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NficP70255 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NficP70255 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NficP70255 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NficP70255 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms