Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acta1P68134 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acta1P68134 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms