Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gabrb3P63080 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb3P63080 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb3P63080 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms