Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrx1P63013 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrx1P63013 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrx1P63013 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Prrx1P63013 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrx1P63013 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrx1P63013 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrx1P63013 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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