Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps28P62858 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps28P62858 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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