Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps25P62852 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps25P62852 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms