Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Copz1P61924 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Copz1P61924 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copz1P61924 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms