Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg6P61406 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg6P61406 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms