Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Snap25P60879 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Snap25P60879 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Snap25P60879 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms