Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rims4P60191 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims4P60191 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms