Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphp4P59240 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nphp4P59240 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms