Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samsn1P57725 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samsn1P57725 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms