Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gsc2P56916 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsc2P56916 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms