Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd38P56528 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd38P56528 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd38P56528 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms