Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GferP56213 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GferP56213 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GferP56213 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GferP56213 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GferP56213 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GferP56213 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GferP56213 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GferP56213 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GferP56213 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms