Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aqp4P55088 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aqp4P55088 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms