Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acod1P54987 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms