Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fdft1P53798 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms