Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClgnP52194 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms