Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XpcP51612 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XpcP51612 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XpcP51612 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XpcP51612 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XpcP51612 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XpcP51612 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XpcP51612 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XpcP51612 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XpcP51612 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms