Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnt2P50752 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms