Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa8P50706 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa8P50706 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms