Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabrb1P50571 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms