Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd7P50283 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd7P50283 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd7P50283 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd7P50283 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms