Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp9P49962 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp9P49962 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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