Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpreP49446 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtpreP49446 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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