Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TbcaP48428 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TbcaP48428 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TbcaP48428 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TbcaP48428 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TbcaP48428 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TbcaP48428 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TbcaP48428 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TbcaP48428 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TbcaP48428 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
TbcaP48428 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TbcaP48428 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms