Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gbx2P48031 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbx2P48031 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms