Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl29P47915 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl29P47915 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms