Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms