Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NodalP43021 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NodalP43021 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NodalP43021 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NodalP43021 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NodalP43021 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NodalP43021 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NodalP43021 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NodalP43021 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NodalP43021 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NodalP43021 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms