Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd1P40201 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chd1P40201 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chd1P40201 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Chd1P40201 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Chd1P40201 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chd1P40201 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Chd1P40201 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chd1P40201 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms