Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik2P39087 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms