Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col18a1P39061 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col18a1P39061 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col18a1P39061 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms