Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lig1P37913 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lig1P37913 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lig1P37913 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lig1P37913 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms