Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl12P35979 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl12P35979 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl12P35979 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl12P35979 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl12P35979 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl12P35979 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl12P35979 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl12P35979 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl12P35979 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl12P35979 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms