Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rfc1P35601 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rfc1P35601 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms