Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2aP35436 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Grin2aP35436 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Grin2aP35436 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Grin2aP35436 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms