Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc1P34928 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms