Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tfap2aP34056 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms