Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pola1P33609 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Pola1P33609 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pola1P33609 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms