Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxrgP28705 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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