Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RxraP28700 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RxraP28700 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RxraP28700 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RxraP28700 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RxraP28700 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RxraP28700 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RxraP28700 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RxraP28700 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms