Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Celf1P28659 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Celf1P28659 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms