Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a9P28571 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms