Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd10P28359 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms